Le mont Fuji est entré en éruption pour la dernière fois en 1707, et les cendres sont tombées sur Edo — l'actuelle Tokyo — à environ 100 kilomètres de là. L'éruption de Hōei a laissé un cratère sur le flanc sud-est qui reste visible depuis les airs aujourd'hui.
La montagne est calme depuis, mais elle est toujours classée comme active, et le système volcanique qui l'a formée a également construit Hakone, la caldeira effondrée située au sud-est. Tout tour du mont Fuji et de Hakone en train à grande vitesse voyage, en effet, entre deux chapitres de la même histoire géologique.
Le Fuji est un stratovolcan de 3 776 mètres, le point culminant du Japon, et un composite de trois volcans empilés en séquence sur des centaines de milliers d'années. Il a été inscrit sur la liste du patrimoine mondial de l'UNESCO en 2013 — non pas en tant que site naturel, mais en tant que site culturel. L'inscription reconnaît le rôle de la montagne dans la pratique shintoïste et bouddhiste, dans les confréries de pèlerinage Fujikō de l'époque d'Edo, et dans l'art. Les Trente-six vues du mont Fuji de Hokusai, imprimées dans les années 1830, ont fixé la silhouette du cône dans l'imaginaire mondial avant même que la photographie n'existe.
L'histoire de Hakone se déroule en parallèle. La caldeira s'est formée il y a environ 40 000 ans ; le lac Ashi remplit une partie du sol du cratère, endigué par un glissement de terrain vieux d'environ 3 000 ans. Owakudani, la vallée des évents sulfureux au-dessus du lac, émet toujours de la vapeur et du sulfure d'hydrogène, et les œufs noirs bouillis dans ses sources chaudes restent un emblème local. À l'époque d'Edo, Hakone abritait l'une des stations de contrôle les plus importantes sur la route du Tōkaidō entre Kyoto et Edo, où les documents des voyageurs étaient vérifiés sous des avenues de cryptomères qui subsistent encore.
Le chemin de fer a tout changé. Le Tōkaidō Shinkansen a ouvert en 1964 et a réduit le trajet le long du même corridor à quelques heures ; la gare d'Odawara, la porte d'entrée de Hakone, se trouve sur la ligne. C'est pourquoi un tour du mont Fuji et de Hakone en train à grande vitesse fonctionne comme une journée unique plutôt que comme une expédition avec nuitée. L'accès à la montagne elle-même remonte la ligne Fuji Subaru jusqu'à la 5e station à 2 300 mètres, au-dessus de la limite des arbres et en dessous du sommet. Les circuits de Hakone combinant le téléphérique et la croisière sur le lac Ashi suivent le bord de la caldeira. Les circuits touristiques du mont Fuji et de Hakone de ce type sont moins un itinéraire qu'une compression de géologie, de pèlerinage et d'ingénierie en un seul méridien de voyage.
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